Em finais dos anos 30, existiam em Peniche três equipas de futebol: Relâmpago Foot-Ball Club, com equipamento preto e branco em velas de moinho, o Faísca equipado de vermelho e branco em listas verticais e o Peniche Foot-Ball Clube de camisola azul e calção branco.
Entretanto, o Faísca fechou as portas na altura em que apareceu em Peniche um jovem médico-cirurgião, que depressa deu conta da dispersão de valores então existente. Dispersão essa tanto em atletas como no plano Directivo. O Dr. Ernesto Moreira - foi ele o grande dinamizador- meteu mãos à obra e conseguiu reunir à sua volta todos os valores existentes. As sementes foram lançadas e a sementeira foi bastante positiva. À sua voz outras se juntaram e assim nasceu o Grupo Desportivo de Peniche, Clube de que Peniche tanto se tem orgulhado.
O clube esteve durante muito tempo (a partir do final dos anos 1940) na antiga 2ª Divisão Nacional, com raras presenças na 3ª Divisão Nacional, como foi o caso das épocas de 1979/80 e 1980/81. Nunca conseguiu ser promovida à 1ª Divisão, mas quase alcançou esse feito algumas vezes como na época 1971/72, em que perdeu na última jornada da liguilha de acesso À 1ª Divisão.
A partir da época de 1990/1991 militou na 3ª Divisão, voltou em 1992/1993 à então designada de 2ª Divisão B, alternando com mais algumas presenças na 3ª Divisão Nacional, que se tornaram frequentes entre as épocas de 2000/2001 a 2006/2007.
Na época de 2007-2008, a equipa de seniores masculinos participou no campeonato distrital da divisão de honra da associação de futebol de Leiria.
Na época de 2008-2009, a equipa encontra-se a disputar a Série D da Terceira Divisão Portuguesa de futebol.
O melhor resultado do Grupo Desportivo de Peniche na Taça de Portugal foi na época 1985/1986, alcançando os oitavos-de-final, perdendo com o Varzim por 1-0.
O Grupo Desportivo Peniche é a filial nº 14 do Belenenses.
